Courses

30/10 – 8:30 às 13:00

  • MC2 – Ferramentas de bioinformática para sequenciamento de alto desempenho: Tainá Raiol (UnB)
    • Conceitos básicos de Biologia Molecular e Genômica
    • Sequenciamento de nucleotídeos e pipelines computacionais
    • Filtragem de sequências
    • Montagem de contigs
    • Alinhamento de sequências
    • Interpretação biológica dos resultados

30/10 – 14:00 às 18:30

  • MC1 – Apoio computacional a análises filogenômicas em larga escala: Kary Ocaña (LNCC), Andre Soares (LNCC) e Gustavo Saboia (LNCC)
    • Aplicações dos métodos de análise filogenômica.
    • Métodos de máxima verossimilhança. RAxML. Processamento de alto desempenho (PAD)
    • Introdução aos conceitos em evolução molecular.
    • Métodos de inferência Bayesiana.
  • MC3 – Bioinformática Básica: Waldeyr Mendes (IFG)
    • Conceitos Básicos de Biologia Molecular
    • Comparação de sequências
    • Dados de sequenciamento de alto desempenho e seus formatos
    • Filtragem e montagem de fragmentos
    • Anotação
    • Prática em laboratório (Linux)
  • MC4 – Análises de metagenomas usando a Plataforma Galaxy: Alberto Dávila (FIOCRUZ), Rodrigo Jardim (FIOCRUZ) e Nelson Peixoto (FIOCRUZ)
    • Carga de dados de metagenoma (microbioma) no Galaxy
    • Verificação da qualidade e limpeza dos dados
    • Clusterização
    • Busca por similaridade (kraken)
    • Classificação das OTU’s
    • Estudo (visualização) taxonômico.