30/10 – 8:30 às 13:00
- MC2 – Ferramentas de bioinformática para sequenciamento de alto desempenho: Tainá Raiol (UnB)
- Conceitos básicos de Biologia Molecular e Genômica
- Sequenciamento de nucleotídeos e pipelines computacionais
- Filtragem de sequências
- Montagem de contigs
- Alinhamento de sequências
- Interpretação biológica dos resultados
30/10 – 14:00 às 18:30
- MC1 – Apoio computacional a análises filogenômicas em larga escala: Kary Ocaña (LNCC), Andre Soares (LNCC) e Gustavo Saboia (LNCC)
- Aplicações dos métodos de análise filogenômica.
- Métodos de máxima verossimilhança. RAxML. Processamento de alto desempenho (PAD)
- Introdução aos conceitos em evolução molecular.
- Métodos de inferência Bayesiana.
- MC3 – Bioinformática Básica: Waldeyr Mendes (IFG)
-
- Conceitos Básicos de Biologia Molecular
- Comparação de sequências
- Dados de sequenciamento de alto desempenho e seus formatos
- Filtragem e montagem de fragmentos
- Anotação
- Prática em laboratório (Linux)
- MC4 – Análises de metagenomas usando a Plataforma Galaxy: Alberto Dávila (FIOCRUZ), Rodrigo Jardim (FIOCRUZ) e Nelson Peixoto (FIOCRUZ)
- Carga de dados de metagenoma (microbioma) no Galaxy
- Verificação da qualidade e limpeza dos dados
- Clusterização
- Busca por similaridade (kraken)
- Classificação das OTU’s
- Estudo (visualização) taxonômico.